雖然兩派沖突明顯，但6月20日，與那國町議會還是以3票贊成，2票反對通過了租借協議。特約觀察員蔣豐認為，除了日本政府在持續施壓，防衛省暗中許諾的諸多利益才最終買通了與那國島的居民。

　　蔣豐：現在雖然說這10億日元的所謂的補償費被取消了，但是防衛省內部消息表明，到2016年為止，將給當地再投資，來整頓當地的基礎設施建設，當然也包括一些駐軍的建設，所以這應該是他們的一個背后交易。

　　據日本媒體報道，被租借的土地將一分為二來使用，一處將作為海岸警備部隊的營地，而另一處則用來部署監控雷達。其實早在2005年台海危機，日本軍方就謀劃在這裡建設軍事基地，監視台灣東海灣情況。當中日關系緊張后，與那國島又成為日本步步緊逼的一步棋。

　　軍事專家宋曉軍認為，與那國島為軍事基地開綠燈，除了因其地理位置確實特殊，此時通過租借協議也耐人尋味，因為此時距離日本參院選舉僅有30天。

　　宋曉軍：日本參議院7月份選舉，日本突然就把這件事搞定，日本除了炒作釣魚島，還要炒作中國威脅論，與那國島最終簽訂一個協議，由自衛隊進駐一個監視和電子部隊的話，這也是安倍政府為他7月份參議院大選放的一顆爆竹，如果一旦參議院自民黨過半，很可能日本先把它的自衛隊改成國防軍，然后逐漸推進修改憲法這樣一個步驟，最終使得日本成為一個所謂的正常國家。